El sector cafetalero también reporta pérdidas preliminares por las persistentes lluvias de la Tormenta Sara.  De acuerdo con Sergio Ticas, presidente de la Asociación Cafetalera, a la fecha se estiman unos 30,000 quintales de café dañados, ya sea porque el grano se ha reventado y ha caído al suelo o porque se ha llenado de hongos, debido a la humedad. De acuerdo con Ticas, este número de quintales representa casi el 8% de toda la cosecha de café que ya está en curso. 

“El café es bien delicado y con varios días de lluvias corre mucho riesgo”, dijo Ticas. 
Dadas las condiciones climáticas, la Asociación ha recomendado a sus agremiados que hagan una cosecha inmediata de todos los frutos maduros a fin de que no se pierda más. 
Además han recomendado que estén monitoreando la detección de cualquier enfermedad, como la roya, el ojo de gallo y la antracnosis,  pues,  según Ticas, las condiciones climáticas son ideales para que estas se desarrollen. 

En algunos casos también se ha recomendado aplicar fungicidas y realizar una poda preventiva cuando la lluvia cese. 

Ticas lamentó, sin embargo, que las autoridades no se hayan pronunciado por la afectación. “A todos los caficultores nos preocupa mucho que el Instituto Salvadoreño del Café, que es el rector de la caficultura, hasta el momento no se ha pronunciado dándonos recomendaciones para minimizar las pérdidas”, dijo.